首先，分子病理诊断为的诊断及鉴别诊断提供了依据，当遇到少见疑难或罕见---时，尤其是通过形态学和免yi组化染色仍不能确定的类型，这时候就需要借助分子病理技术，从基因水平来判断---的异常情况，协助病理医生作出相对准确的诊断并判断该---的预后及转归。应用领域广泛的要数软组织和骨、淋巴造血系统，因为这些系统的相似而不同，单靠镜下表现和已知的已无法满足诊断需求。另外，分子病理检测也常常运用在分子分型中，比如大家熟知的分子分型，通过基因表达谱研究，可将分为管腔a型、b型，her-2阳性型，基底样型。
原位杂交杂交液注意事项：
（1）杂交液内除含一定浓度的标记探针外，还含有较高浓度的盐类、---胺、---葡聚糖、牛血1清白蛋白及载体dna或rna等。
（2）杂交液中含有较高浓度的na+可使杂交率增加，可以减低探针与组织标本之间的静电结合。---胺可使tm降低，杂交液中含每1%的---胺可分别使rna：rna，rna：dna，dna：dna的杂交温度降低0.35℃，0.5℃和0.65℃。，所以杂交液中加入适量的---胺，分子病理技术服务，可避免因杂交温度过高而引起的组织形态结构的破坏以及标本的脱落。---葡聚糖能与水结合，从而减少杂交液的有效容积，提高探针有效浓度，以达到提高杂交率的目的（尤其对双链---探针）。
在杂交液中加入牛血1清白蛋白及载体dna或rna等，都是为了阻断探针与组织结构成分之间的非特---结合，以减低背景。
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