染色体原位杂交实验的基本原理是利用特定标记的已知碱基序列的---探针，依据碱基互补配对原理，与中期染色体玻片标本中的同源 dna 序列进行杂交。
标记可以用放1射性同位素（3h、35s、32p），然后进行放1射自显影；也可以用非放1射性的荧光素生物素、地1高辛，再用荧光显微镜进行观察，即荧光原位杂交（fluorescent in situhybridization，fish）技术。
原位杂交天
1. 重新水化和固定
1） 吸取固定好的胚胎，加入50%的pbst溶液，放置5分钟。
2） 置换成30%的pbst溶液，放置5分钟
3） 置换成pbst溶液，放置5分钟，重复一次
4） 置换成4%---的pbs溶液固定20分钟5） 用pbst洗两次，每次放置五分钟，室温。
蛋白酶处理与后固定（本实验不做此步）
1） 用10ul/ml的蛋白酶k在室温下处理胚胎。5体节以下的胚胎不处理，5体节到24小时的胚胎处理3分钟，24小时以上的胚胎处理5分钟或者更长。发育时间越短的胚胎越嫩，可以不用或者少用蛋白酶处理，发育时间长的胚胎就需要用蛋白酶来疏松组织，以便于杂交。
2） 用pbst溶液轻洗，在pbst中放置5分钟。
3） 用4%---的pbs溶液固定20分钟，室温。
4） 用pbst洗两次，每次放置五分钟，分子病理技术服务，室温。
2. 预杂交
1）每个管中置换成大约300ulhyb－溶液，60℃水浴5分钟，避免振荡。
2）用等体积的hyb+取代hyb－。
3）60℃水浴，预杂交4小时以上。
3. 杂交
1）吸去预杂交的hyb+，加上100ul已加入探针的hyb+溶液（探针浓度约为1ng/ul）..
2）60℃ 温浴过夜。注：杂交与预杂交的温度可以是55到60度不等，温度越低，探针结合越好，温度越高，背景越小。
原位杂交试验
收集斑马鱼的胚胎，在holfretor水中培养，到达所需要的发育时期时，用蛋白酶去除卵膜，用4%---固定，在4℃保存，二十四小时后用50%2%---溶液洗，然后换成，在-20c 保存，待用（两天和两天以上的胚胎需要用处理，去除色素。或者使用---锍脲稀溶液培养，可阻断色素的形成） 武汉科锐诺生物科技有限公司
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