目前，我国已稳定开展的分子病理技术主要有显色原位杂交、荧光原位杂交、pcr、荧光定量pcr、基因芯片和dna测序技术。显色原位杂交(chromogenicinsituhybridization，cish)技术是分子生物学、组织化学及细胞学相结合产生的一门新兴技术，是利用---分子单链间碱基互补的原理，将地1高辛或生物素标记的外源---探针与组织、细胞或染色体上待测dna或rna互补配对，结合成双链杂交分子，通过---化物酶或碱性磷酸酶的呈色反应将待测---在组织、细胞或染色体上的位置显示出来。根据探针种类不同可分为dna原位杂交和rna原位杂交。
应用于分子病理诊断的dna测序技术有直接测序法和焦磷酸测序法。直接测序技术主要是sanger等发明的双脱氧链末端终止法。其原理就是根据核苷酸在某一固定的点开始，随机在某一个特定的碱基处终止，产生a、t、c、g4组不同长度的一系列核苷酸，然后在尿素变性的page胶上电泳进行检测，植物原位杂交服务，从而获得dna序列。直接测序法是基因突变检测的“金标准”，其优点是结果准确，重复性好，可检测整个测序范围内已知和未知突变点;缺点是步骤多，耗时长，灵敏度低，过程不易控制，在检测已知突变位点方面将逐渐被荧光定量pcｒ法替代。
分子病理诊断，是指应用分子生物学技术，从基因水平上检测细胞和组织的分子遗传学变化，以协助病理诊断和分型、指导靶向、预测反应及判断预后的一种病理诊断技术。分子病理诊断又称分子病理检查、分子病理检测、分子病理技术。从本质上讲，凡是基于组织和细胞分子水平上的---诊断都是分子病理诊断，这是广义的分子病理诊断，如组化诊断。但目前---的是狭义的分子病理诊断，即基于细胞或组织基因水平的病理诊断。
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